Лукът се задушава в олиото до прозрачност. Прибавя се каймата и се бърка до пълното й размесване с лука. След запържването на каймата се прибавят лютеницата, черния и лютия пипер. Добавя се 400-500 мл вода или бульон, подсолява на вкус и се оставя да заври. Картофите се нарязват на ситно и се нарежда един пласт в тавичка. Втори пласт се изсипва половината от запържената кайма, отново картофи и нов пласт кайма. Поставя се тавата в загрята фурна и се пече до омекване на картофите. Ако водата изври се добавя топла вода, но малко, така че когато картофите омекнат мусаката да бъде почти само на мазнина. От яйцата и киселото мляко се приготвя заливка като се разбиват заедно в съд. Заливката се излива равномерно върху готовата мусака и се пече до златисто оцветяване.