Хлябът се нарязва на дребни кубчета и се запича на фурна до златист цвят. Лукът се задушава с олиото и малко вода. Добавят се червеният пипер и мляното месо. Задушава се, като се разбърква, докато месото стане дребнозърнеста маса. Прибавят се хлябът, доматеното пюре, половината прясно мляко, натрошеното сирене, черният пипер, солта, половината от магданоза (дребно нарязан). Разбърква се добре.
На дъното на тавичка или гювечета се поставят кръгчета домати. Върху тях се разпределя сместа. Пече се във фурна 20 минути при умерена температура.
Приготвя се заливка от брашното, киселото мляко, остатъка от прясното мляко, яйцата, разтопеното масло, настъргания кашкавал и сол на вкус. Разбива се добре. Към края на печенето заливката се разпределя равномерно върху сместа. Допича се при същата температура. Мусаката се поднася поръсена с останалия магданоз.